находился в 4 км к югу от Вел. Новгорода у истока р. Волхов, на ее правом берегу, южнее Сиверсова канала (ныне урочище у дер. Сковородка Новгородского р-на и обл.). Обитель располагалась «в местности, имеющей вид сковороды, т. е. круглой, в середине углубленной, с отлогим возвышением по краям» (Зверинский. Т. 2. С. 309).
Церковь во имя арх. Михаила «на Сковоротке» (Михаило-Сковородская) была возведена на средства архиеп. Новгородского свт. Моисея в 1355 г., но об основании при храме мон-ря новгородский владычный летописец не указывает (НПЛ. С. 364). Сообщение об одновременном учреждении мон-ря и о возведении храма «на Сковородке» появляется только в летописании XVI-XVII вв. (ПСРЛ. Т. 30. С. 198; НовгорЛет. С. 233-234). Судя по архитектурному облику (одноглавая, с 3-лопастным покрытием без 3-частного деления фасадов, с невысокой полукруглой апсидой, деревянными хорами в зап. части), церковь была построена той же артелью мастеров, к-рая в 1352 г. возвела каменную Успенскую ц. на Волотовом поле. С зап. стороны храм имел небольшой притвор. Предположительно, ок. 1360 г. Михайловская ц. была расписана (существуют также т. зр. о росписи храма в кон. XIV или в нач. XV в.). Как отмечал архим. Макарий (Миролюбов), над алтарем Михайловского собора были «устроены какие-то полати, служившие, вероятно, вместо ризницы, или библиотеки. Теперь (в сер. XIX в.- М. П.) ход туда заложен» (Макарий (Миролюбов). 1860. Ч. 1. С. 620. Примеч. 472).
После того как 28 авг. 1359 г. свт. Моисей окончательно покинул Новгородскую кафедру «по своеи воли, немощи деля своея» (НПЛ. С. 365), он удалился на покой, вероятно, в С. М. м. (ср.: Там же. С. 366, 368), где впосл. и был погребен 25 янв. 1363 г. новым архиеп. Новгородским свт. Алексием и собором духовенства в присутствии множества горожан.
Как иноческая обитель С. М. м. впервые упоминается в новгородской владычной летописи в 1386 г., когда при приближении к Новгороду войск Московского и Владимирского вел. кн. блгв. Димитрия Иоанновича Донского 24 пригородных новгородских монастыря были сожжены, в т. ч. и С. М. м. (ПСРЛ. Т. 4. Ч. 1. С. 346). 30 нояб. 1409 г. в Михайловской ц. начал раздаваться некий звук «в маковице», продолжавшийся 2 дня и 2 ночи, что было воспринято насельниками обители как «чюдо… страшно» (НПЛ. С. 401; ПСРЛ. Т. 4. Ч. 1. С. 409).
В новгородском владычном летописании под 1415 г. как один из кандидатов в Новгородские архиепископы упоминается игумен монастыря Михаил (НПЛ. С. 405; ПСРЛ. Т. 4. Ч. 1. С. 414).
7 янв. 1478 г. по повелению вел. кн. Московского Иоанна III Васильевича был проведен 1-й этап секуляризации церковной собственности в Новгородской и Псковской епархии (в ее новгородской части). Конфисковали не только 10 волостей, бывшие собственностью архиерейского дома, но и недвижимые владения 6 мон-рей. В их число попал и С. М. м., у к-рого было изъято 97 обеж земли (ПСРЛ. Т. 25. С. 319) - значительно меньше, чем у остальных обителей (Хорошев А. С. Церковь в соц.-полит. системе Новгородской феод. республики. М., 1980. С. 161-162). Значимость С. М. м. объясняется не объемом его землевладения, а тем, что, как показал В. Л. Янин, он был одним из тех мон-рей, к-рые входили в структуру Новгородской архимандритии и были связаны с теми или иными городскими концами; С. М. м. являлся кончанским для Славенского конца Новгорода (юж. часть восточной, Торговой стороны) (Янин В. Л. Очерки комплексного источниковедения: Средневек. Новгород. М., 1977. С. 136-149; Он же. Монастыри средневекового Новгорода в структуре гос. институтов // Он же. Средневек. Новгород: Очерки археологии и истории. М., 2004. С. 240-241). В сер. 90-х гг. XV в. С. М. м. имел 115 дворов, 162 тяглецов (зависимых людей, плативших мон-рю оброк), 138 обеж земли (Хорошев А. С. Церковь в соц.-полит. системе Новгородской феод. республики. М., 1980. С. 205. № 33). Вторая конфискация церковного землевладения в Новгородской земле произошла в 1499 г. (ПсковЛет. Вып. 2. С. 252), но в какой степени она затронула непосредственно владения С. М. м., достоверно не известно; в целом владения владыки, церквей и мон-рей Деревской пятины, к которой относился мон-рь «на Сковородке», сократились с 33% всего земельного фонда до 21% (см.: Фролов А. А. Конфискации вотчин новгородского владыки и мон-рей в посл. четв. XV в. // ДРВМ. 2004. № 4(18). С. 54-62).
Первый избранный на Новгородскую и Псковскую кафедру в Москве архиеп. Сергий (1483-1484) во время посещения С. М. м. совершил там молебен. После того как ему рассказали о строителе монастыря свт. Моисее, он распорядился освидетельствовать его мощи, в то время все еще находившиеся под спудом в паперти монастырского собора. Когда священник храма отказался вскрыть гробницу, архиепископ оскорбительно высказался о Новгородском святителе и покинул обитель. После этого, по новгородскому сказанию, архиеп. Сергий заболел и вскоре был вынужден покинуть кафедру (НовгЛет. С. 140 (здесь написано «скрыти» в значении «открыть», «вскрыть»)).
О существовании в С. М. м. б-ки косвенно свидетельствует рукописный сб. «Пчела», к-рый в 1557/58 г. переписал «вкладщик Михаилова манастыря Сковоротки» Григорий Никифоров сын, наиболее вероятно, для вклада в обитель (ГАЯО. № 1265; Шмидт С. О. Малоизвестная запись новгородского книжника XVI в. // Лингвист. источниковедение. М., 1963. С. 148-152; Усачёв А. С. Книгописание в России XVI в.: По мат-лам датированных выходных записей. М.; СПб., 2018. Т. 1. С. 118-119; Т. 2. С. 257-258. № 454).
Если в писцовой книге 1582 г. в С. М. м. отмечался один каменный Михаило-Архангельский храм (Неволин К. А. О пятинах и погостах новгородских в XVI в. СПб., 1853. Прил. 6. С. 135), то в росписи 1615 г., составленной во время швед. оккупации Новгорода, кроме Михайловской с мощами свт. Моисея указана еще и деревянная ц. во имя свт. Николая Чудотворца с трапезной (Анкудинов И. Ю. Роспись новгородских церквей 1615 г. // НИС. 2008. Вып. 11(21). С. 376). В описи 1617 г., составленной после освобождения Новгорода, указывалось на разорение обители: сожжены кельи и ограда, а церковная утварь, книги и иконы (в т. ч. надгробный образ свт. Моисея) перевезены в ближайшую новгородскую ц. св. Илии пророка на Славне (Опись Новгорода 1617 г. М., 1984. Ч. 1. С. 116-117; Ч. 2. С. 326). Видимо, архив мон-ря погиб в Смутное время.
К 20-м гг. XVII в. С. М. м. был возобновлен строителем Сергием (по описи 1620 г., «старец Сергий строится внове после войны немецких и литовских людей» - ИРИ. Т. 6. С. 144). В «Описании новгородской святыни» (до 1634) С. М. м. упоминался как местонахождение мощей свт. Моисея: «...в Деревской пятине, за 4 поприща от Великого Новаграда, в монастыре на Сковородке, в церкве архангела Михаила, мощи архиепископа новгородцкого Моисея под спудом. Поют с полиелеосом» (Янин В. Л. Некрополь новгородского Софийского собора: Церк. традиция и ист. критика. М., 1988. С. 220. Прил. 5). В др. описании новгородских святынь, составленном бывш. протопопом московского Успенского собора Максимом по поручению царицы Евдокии Лукьяновны, говорилось: «На той же стороне реки Волхова, от города три версты, в монастыре архангела Михаила, зовомо на Сковородке, мощи Моисея архиепископа новгородского чудотворца, лежат под спудом. Прославлен от Бога чудесы при животе и по смерти, и прибегающии с верою к честным его мощам, мужие и жены, почерпают здравие, наипаче же жены исцелевают, одержимыя своими естественными немощами» (Описание новгородской святыни в 1634 г. // ЧОИДР. 1862. Кн. 4. Отд. 5. С. 54; Янин В. Л. Некрополь новгородского Софийского собора. М., 1988. Прил. 5. С. 223). Данные сообщения указывают на С. М. м. как на место паломничества жителей Новгорода, прежде всего женщин.
В 1677 г. по указу патриарха Московского и всея Руси Иоакима (Савёлова) об изъятии в Новгородской епархии церковных и монастырских древних «харатейных» книг, не использующихся в богослужении, при строителе Пахомии в Москву из С. М. м. были переданы 26 пергаменных книг, среди них Евангелие напрестольное, Евангелие толковое, неск. рукописей Пролога (ДАИ. Т. 7. С. 306. № 63).
19 апр. 1686 г. в С. М. м. были обретены мощи свт. Моисея (по преданию, когда настоятель с братией вошли в церковь для утреннего пения, она была уже освещена; от мощей, обнаруженных открыто лежавшими среди церкви, исходило благоухание). После этого мощи основателя мон-ря оставались открытыми. По распоряжению митр. Новгородского и Великолуцкого Корнилия мощи свт. Моисея почивали на помосте у правой стороны иконостаса собора С. М. м., а после перестройки храма в нач. XIX в.- «поверх земли открытые между соборною и южною придельною церковью в арке» (ИРИ. Т. 6. С. 142). Когда был построен юж. придел во имя свт. Моисея, в точности не известно. По сообщению митр. Амвросия (Орнатского), придел был освящен митр. Питиримом, под к-рым следует понимать митр. Новгородского Питирима (1664-1672; буд. патриарх Московский и всея Руси). Приводимая митр. Амвросием дата 1493 г. (Там же. С. 144) совершенно неправдоподобна и не имеет никакой опоры в источниках, на ее ошибочность указывал еще архим. Макарий (Миролюбов) (Макарий (Миролюбов). 1860. Ч. 1. С. 618. Примеч. 470). Описи 1-й пол. XVII в. указаний на 3-й в С. М. м. Моисеевский престол не содержат (Писцовые и переписные книги. 2003. С. 96 (1646 г.)). По мнению Л. А. Секретарь, на существование придела в нач. XVII в. указывает роспись новгородских церквей 1615 г. (Секретарь. 2011. С. 511), однако в ней скорее всего говорится не о приделе, а об имеющихся в храме мощах святого, как и в др. подобных отмеченных росписью случаях («храм архангел Михаил, да чюдотворец Моисей владыка, да в трапезе храм древян Никола Чюдотворец» - Анкудинов И. Ю. Роспись новгородских церквей 1615 г. // НИС. 2008. Вып. 11(21). С. 376).
По крайней мере в XVII в. ежегодно в 6-ю Неделю по Пасхе к С. М. м. из кафедрального Софийского собора водным путем по р. Волхов направлялся крестный ход во главе с архиереем, при этом во время одной из остановок софийский протоиерей и чтецы читали Житие свт. Моисея. В мон-ре владыка после молебна и чтения Евангелия совершал водоосвящение и возглавлял служение Божественной литургии. Кроме того, в этот день софийскому клиру был «стол» в С. М. м. (Макарий (Миролюбов). 1860. Ч. 1. С. С. 98, 620-621; Голубцов. Чиновник. С. 222-224). В пятницу сырной недели Новгородский архиерей также ездил «на Сковоротку к чюдотворцу Моисею» (Голубцов. Чиновник. С. 156). По замечанию архим. Макария (Миролюбова) (1860), «теперь крестного хода (к С. М. м.- М. П.) давно уже нет» (Макарий (Миролюбов). 1860. Ч. 1. С. 621. Примеч. 475).
В 1723 г. игумен С. М. м. Симеон присутствовал в С.-Петербурге при встрече мощей блгв. кн. Александра Ярославича Невского, привезенных по повелению имп. Петра I Алексеевича из Владимира-на-Клязьме (ОДДС. Т. 3. С. CXLVI. № 35). В 1744 г. мон-рь владел 380 крестьянами, перед реформой 1764 г.- 374 крестьянами, а также имел 253 дес. пахотной земли. К 1763 г. обитель не имела подворий в Москве, С.-Петербурге или в Новгороде (Анкудинов. 2017. С. 118).
В 1663 г. царь Алексей Михайлович сделал вклад в С. М. м.- Евангелие (М., 1661), подписанное по листам подьячим Иваном Кирилловым, оклад был изготовлен в 1803 г. (Макарий (Миролюбов). 1860. Ч. 1. С. 618; ныне НГОМЗ. КП 1393. ДРМ-378). К кон. XIX в. в соборе мон-ря рядом с ракой свт. Моисея, хранился почитаемый образ свт. Николая Чудотворца кон. XIII в., ранее бывший храмовым в ц. свт. Николая Чудотворца на Липне (построена в 1292) («Никола Липенский»; ныне в НГОМЗ. Инв. № 5769). Появление его в мон-ре объясняется, очевидно, тем, что в 1798 г. упраздненный Липенский монастырь был приписан к С. М. м. В Моисеевском приделе хранился деревянный (кипарисный) крест, находившийся в гробнице свт. Моисея до открытия его мощей 19 апр. 1686 г., с обратной стороны имевший сделанную в кон. XVII в. надпись чернилами о кончине св. архиепископа, его погребении в С. М. м. и об обретении его мощей. В приделе также хранились дубовый гроб, в к-ром был погребен святитель, и его железные вериги.
В 1764 г. С. М. м. был отнесен к необщежительным обителям 3-го класса. К 1778 г., по данным Генерального межевания, владения С. М. м. составляли 31 дес. 1518 саж. земли.
Согласно описи 1764 г., в С. М. м. стояла каменная колокольня, а Михайловский храм имел 3 придела. На территории обители находились 2 деревянные настоятельские кельи и одна братская, с хлебней и сенями, квасоваренная поварня, погреб с сушилом, 2 хлебных амбара, конюшенный сарай, коровий двор. Ограда также была деревянной, за ней имелось мощеное гумно с ригой. В 1777 г., при игум. Митрофане, к западу от Михайловской ц. были возведены настоятельские покои и одноэтажные братские кельи, между к-рыми устроены въездные ворота.
В 1782 г., при архиеп. Новгородском и С.-Петербургском Гаврииле (Петрове), мощи свт. Моисея в Михаило-Архангельском соборе были положены в новую бронзовую позолоченную раку (на ней была надпись: «По двенадесяти летех архиерейства преставися ианнуария 25 дня 1362 лета. Мощи его обретены 1686 года априлия 19 дня. Св. Моисей арх. Новгородский в В. Новеграде хиротононисан св. Петром митрополитом лета 1325, создал Сковородский монастырь» - цит. по: Макарий (Миролюбов). 1860. Ч. 1. С. 617. Примеч. 460). На раке находился покров, изготовленный по заказу новгородца Алексея в благодарность за чудесное спасение во время плавания по р. Неве.
В 1798 г. был возобновлен южный придел Михайловского храма во имя свт. Моисея, освященный 12 сент. еп. Старорусским, викарием Новгородской епархии Досифеем (Ильиным). Сев. придел во имя свт. Николая Чудотворца был построен в 1736 г. на средства новгородского помещика Б. Лихарева; в 1800 г. он был возобновлен и 26 янв. 1801 г. переосвящен в честь Рождества Христова еп. Старорусским Антонием (Знаменским). В 1800 г. была устроена западная паперть собора, над ней возведена колокольня с ризницей.
9 марта 1805 г. вместо игуменского настоятельства в С. М. м. была введена архимандрития. В 1807 г., при архим. Моисее, Михайловская соборная ц. была перестроена и соединена с приделами арками. Вероятно, именно тогда в интерьере храма появилась резная рама иконостаса, украшенная колоннами коринфского ордера. В 1818-1820 гг. с южной стороны к собору была пристроена кирпичная придельная ц. в честь Казанской иконы Божией Матери с отдельным входом с зап. стороны. В 1820 г. по инициативе архим. Герасима (Гайдукова; † 1829) верхняя часть соборного храма была разобрана, возведены 5 глав (4 из них, малые, были глухими) и изготовлена 4-скатная кровля, покрытая листовым железом. Яблоки и кресты глав были обиты белой жестью. Появились новые окна с арочным завершением, с юж. стороны от храма был построен амбар. В 1810-1811 гг., при архим. Гедеоне (Мошатине; 1761-1829), мон-рь был окружен каменной оградой с угловыми башнями. В 1802 г. были возведены двух- и одноэтажные братские корпуса, каменное здание с братской трапезной, квасоварней и кухней, каменная баня. Также в нач. XIX в. были построены гостиница, странноприимный дом. В 1892 г. на месте братских келий был возведен 2-этажный каменный настоятельский корпус с проездными воротами, над которыми возвышалась ярусная колокольня (был сохранен ветхий одноэтажный корпус (1777 г.)). В кон. XIX - нач. XX в. за оградой С. М. м. были устроены телятник, деревянное гумно с ригой, ветряная мельница на бревенчатом срубе.
В 1900 г. на монастырском подворье в С.-Петербурге был возведен и 19 нояб. того же года освящен деревянный храм во имя свт. Новгородского Моисея и прп. Иоанна Ветхопещерника с приделами во имя арх. Михаила и во имя блгв. кн. Александра Невского (освящен 28 янв. 1901) на 2 тыс. чел. (архит. Н. Н. Никонов). Здание церкви, бывшей до 1933 г. приходской (принадлежала «иосифлянам»), было разобрано в годы Великой Отечественной войны (ок. 1943). К 1908 г. С. М. м. владел 443 дес. земли, получал из казны 669 р. 54 к., в обители проживали архимандрит и 11 насельников.
В 1920 г. С. М. м. был закрыт. Настоятель (с 1912) игум. Митрофан находился под следствием в ревтрибунале за якобы имевшее место сокрытие денежных средств и ржи в тайнике, в алтаре соборного храма. Монастырская земля была передана местной сельхозкоммуне. После нового следствия в том же году был конфискован монастырский капитал. В 1922 г. в бывш. обители происходило изъятие церковных ценностей, в частности была конфискована рака (1782) свт. Моисея. Через нек-рое время в зданиях бывш. мон-ря открылся дом инвалидов им. Я. М. Свердлова. Михайловская ц. («церковь Моисея Сковородского») оставалась действующей приходской до 1933 г., когда по постановлению райисполкома ее здание было передано дому инвалидов. Каменная ограда с башнями и большинство хозяйственных построек были разобраны в 1934 г.
24 февр. 1936 г. в присутствии ок. 40 местных жителей - колхозников и учащихся дер. Сковородка - гробница с мощами свт. Моисея была вскрыта спецкомиссией по постановлению Леноблисполкома. 22 июня 1936 г. здание Михаило-Сковородского собора, мощи свт. Моисея, приписываемый ему напрестольный крест и проч. реликвии, находившиеся в соборе, были переданы Новгородскому музею (Кафедра новгородских святителей. Вел. Новг., 2011. Т. 1. С. 237, 241-245, 248-252).
С 1937-1938 гг. под рук. А. И. Анисимова и Ю. А. Олсуфьева велись раскрытие и реставрация первоначальных фресок Михайловского собора, фрагменты которых были обнаружены в 1928 г. Во время оккупации Новгорода, в 1941-1944 гг., бывш. обитель находилась в зоне интенсивных боевых действий, ее здания были полностью разрушены артиллерийским огнем. Сохранившиеся руины Михайловского собора остаются незаконсервированными. Найденные при археологических раскопках фрагменты фресок Михайловского храма реставрируются и используются для реконструкции утраченной храмовой стенописи.